肺炎における標的次世代シーケンス：原因病原体・薬剤耐性・毒力の検出への応用

概要

前向き78例の肺炎患者で、tNGSは原因病原体を高精度（精度0.852）で同定し、同時に薬剤耐性および毒力遺伝子も検出した。毒力遺伝子の存在は重症肺炎およびARDS（急性呼吸窮迫症候群）の高頻度と関連し、tNGSが診断と重症度評価の双方に資する可能性が示された。

主要発見

• tNGS・mNGS・従来検査を用いた78検体（BALF67、喀痰11）の前向き解析。
• tNGSの病原体検出精度は0.852（95%CI 0.786–0.918）で、mNGSと同等かつ従来検査より優れていた。
• 81のAMR遺伝子を検出し、優先耐性病原体の75.8%（25/33）を直接同定。
• 毒力遺伝子を144検出し、毒力陽性群は重症肺炎（95.0% vs 42.9%、P=0.009）およびARDS（55.0% vs 0%、P=0.022）が高率であった。

臨床的意義

tNGSは早期の病因診断を効率化し、AMRプロファイルに基づく抗菌薬選択を支援し、毒力遺伝子陽性など高リスク患者のARDS監視強化に資する。導入により、状況に応じて従来検査の補完または一部代替が可能となる。

限界

• 単施設かつ症例数が比較的少ない（n=78）。
• 臨床転帰への影響、検査所要時間、費用対効果は直接評価されていない。

今後の方向性

多施設検証、抗菌薬適正使用やICUトリアージへの統合、検査所要時間・臨床効果・費用対効果の前向き評価が望まれる。