敗血症性ARDSにおけるオートファジー関連バイオマーカーのバイオインフォマティクス解析による同定

概要

統合トランスクリプトーム解析により、敗血症性ARDSで18個のオートファジー関連DEGを同定し、エンドサイトーシスや免疫シグナル経路との関連が示された。LPS刺激Beas-2B細胞で6つのハブ遺伝子の発現低下をqPCRで確認し、バイオマーカーや治療標的候補を提示した。

主要発見

• WGCNA・DEG・PPI解析により、敗血症性ARDSで18のオートファジー関連DEGを同定し、ROCで診断的潜在性を示した。
• 経路解析でエンドサイトーシス、アポトーシス、補体系、IL-2/STAT5、KRASシグナルの変化が示唆された。
• LPS刺激Beas-2B細胞で6つのハブ遺伝子の有意な発現低下をqPCRで検証した。

臨床的意義

臨床的に検証されれば、同定ハブ遺伝子は早期診断やリスク層別化、オートファジー調節療法の対象選定に資する可能性がある。

限界

• 臨床サンプルの規模やコホートが明確でなく、外部患者レベルの検証を欠く
• 検証は単一気道上皮細胞株と急性LPSモデルに限定

今後の方向性

前向き患者コホートでの蛋白レベル評価、組織局在解析、候補遺伝子の機能改変によるin vivo ARDSモデル検証が必要。