凍結ヒト組織の単一細胞トランスクリプトミクスにおける酢酸–メタノール高塩（ACME HS）解離法の比較評価

概要

酢酸・メタノール解離に高塩洗浄を組み合わせたACME HSを最適化し、凍結ヒト内分泌組織からのscRNA-seq用の完全な細胞回収を実現しました。41検体での比較により、ACME HSは酵素解離や核抽出に比べ、細胞型の保持とQC指標で良好な成績を示しました。

主要発見

• ACME HS（酢酸・メタノール＋高塩洗浄）は凍結内分泌組織からの細胞形態とRNA完全性を保持する。
• 41検体の比較で、ACME HSは酵素解離や核抽出と比べ主要細胞型と遺伝子発現を良好に維持し、QC指標も優れていた。
• 再水和時の高塩緩衝液によりRNase再活性化が抑えられ、RNAが安定し転写産物のアーティファクトが最小化された。

臨床的意義

直接の臨床応用ではありませんが、甲状腺や膵臓などのヒト内分泌臓器の大規模で偏りの少ない単一細胞アトラス構築を促進し、疾患機序や治療標的の探索を加速します。

限界

• 主として方法論研究であり臨床アウトカムは未評価；評価対象外組織への一般化には追加検証が必要。
• 保存期間や保存条件の多様性に対する性能は網羅的には検証されていない。

今後の方向性

甲状腺癌や膵島自己免疫など疾患組織でのベンチマーク、多層オミクスとの統合、バイオバンク標準手順への実装が望まれます。