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甲状腺ホルモントランスポーターMCT8変異の疾患重症度への対応づけ:ゲノム・表現型・機能・構造・深層学習の統合解析

Nature communications2025-03-13PubMed
総合: 90.0革新性: 9インパクト: 9厳密性: 9引用可能性: 9

概要

本研究は、MCT8変異クラスを生存や32項目中24項目の臨床特徴に対応づけ、一般集団での軽度フェノコピーを示し、7つの機能ドメインを同定、8,151変異に対する病的度・重症度分類器(AUC 0.91/0.86)を提供しました。治療効果はLoFカテゴリ間で差がなく、遺伝カウンセリングや試験設計に資する知見です。

主要発見

  • MCT8欠損における遺伝子型‐表現型関係は、生存および疾患特徴32項目中24項目に及んだ。
  • 一般集団約40万人において、MCT8の一般的多型が軽度フェノコピーを呈した。
  • MCT8の7つの機能ドメインを同定し、構造的理解を前進させた。
  • AI分類器は8,151変異の病的度(AUC 0.91)と重症度(AUC 0.86)を高精度で予測した。
  • 治療効果は喪失機能(LoF)カテゴリ間で差がなかった。

臨床的意義

SLC16A2/MCT8変異の臨床解釈を改善し、早期診断と重症度評価の標準化を可能にする。遺伝学的ワークフローへの分類器の導入を支援し、治療反応性がLoFクラスに依存しない可能性を示唆する。

なぜ重要か

介入可能な内分泌関連遺伝子におけるバリアント解釈を高精度で一般化可能な枠組みとして示し、診断・予後・試験層別化に直結する。

限界

  • 希少疾患であり、広範な祖先集団での検証なしには即時の一般化に限界がある
  • 分類器の前向き臨床有用性と費用対効果は今後の検証が必要

今後の方向性

診断ワークフローへの前向き実装、さまざまな祖先集団での検証、治療層別化と転帰評価の検討。

研究情報

研究タイプ
コホート研究
研究領域
診断
エビデンスレベル
III - 非ランダム化の多コホート統合トランスレーショナル研究(機能的検証あり)
研究デザイン
OTHER