SARS-CoV-2の3波にわたる変異株とワクチンが鼻粘膜免疫に及ぼす影響

概要

祖先株、Delta、Omicronの各波における接種者・非接種者の鼻咽頭スワブを単一細胞RNAシーケンスで解析し、DeltaとOmicronで鼻粘膜の細胞組成が類似し、骨髄系細胞やT細胞、ウイルス転写物がパターンを規定することを示した。本統合データは、変異株およびワクチン接種状況が粘膜免疫景観をどのように形作るかを明らかにする。

主要発見

• 祖先株・Delta・Omicronの感染にわたる鼻咽頭スワブの単一細胞RNA解析により、DeltaとOmicronで鼻粘膜の細胞組成が類似することが示された。
• 骨髄系細胞およびT細胞集団、さらにSARS-CoV-2転写物が鼻粘膜の免疫景観を大きく規定した。
• 接種者・非接種者を含む統合解析により、ワクチン接種状況と変異株の違いが粘膜応答に与える影響が位置づけられた。

臨床的意義

変異株・ワクチンによって調節される鼻粘膜免疫の知見は、粘膜ワクチン戦略、追加接種の時期、上気道の自然免疫・獲得免疫標的治療の最適化に資する。

限界

• 急性感染期の横断的サンプリングであり、時間的因果の推定に限界がある
• サンプルサイズやバッチ効果に関する詳細が抄録内では明示されていない

今後の方向性

感染経時や追加接種を含む縦断的単一細胞プロファイリングを行い、粘膜免疫と伝播・症状・ワクチン有効性との連関を解明する。