肺微生物叢ランドスケープの遷移は肺炎進行の異なるパターンと関連する

概要

気管支鏡検体に対する16S・メタゲノム・メタトランスクリプトーム・菌量の統合解析により、肺炎サブタイプや治療反応性を予測する肺微生物叢の動的状態を定義しました。誤嚥は微生物の遺伝子発現と群集構造の協調的変化に結び付く撹乱因子として浮上しました。

主要発見

• マルチオミクスと菌量定量の統合により、肺炎経過にわたる肺微生物叢の動的状態を描出した。
• 微生物叢の状態は肺炎サブタイプを予測し、安定性や治療反応性に差を示した。
• 誤嚥は微生物の遺伝子発現と群集構造の協調的変化と関連していた。

臨床的意義

微生物叢状態のプロファイルは、肺炎サブタイプの診断補助、誤嚥対策の導入、治療反応性の予測に資し、抗菌薬や支持療法の最適化につながる可能性があります。

限界

• 観察研究であり、微生物叢変化と転帰の因果推論には限界がある。
• 外部検証や、抗菌薬曝露が異なる状況での標準化サンプリングが必要。

今後の方向性

微生物叢状態分類器の前向き検証、誤嚥やディスバイオシスを標的とした介入試験、宿主オミクスとの統合による実装可能な意思決定支援の構築。