臨床データ統合型全国ゲノムサーベイランスにより、菌血症における高リスククローン Staphylococcus aureus ST764-SCCmecII を同定

概要

臨床転帰を統合した全国ゲノムサーベイランスにより、MRSA ST764-SCCmecIIが日本で30日死亡率の最も高い菌血症クローンであると同定された。1994年頃にNY/Japanクローンから派生し、ファージを介してスーパー抗原毒素や耐性因子を獲得したことが示された。

主要発見

• 2019–2020年の菌血症由来S. aureus 580株の解析で、MRSA ST764-SCCmecIIは入院30日死亡率が最も高かった。
• ST764-SCCmecIIはNY/Japanクローン（ST5-SCCmecII）から派生し、約1994年以降にスーパー抗原毒素ファージと耐性遺伝子を可動性要素で獲得した。
• ゲノムと臨床データ統合により、東西日本でのクローン分布と3主要クローン複合体の重要性が明らかになった。

臨床的意義

高リスクMRSA系統の検出にゲノムサーベイランスの導入を検討すべきであり、ST764-SCCmecIIの認識はMRSA経験的治療、隔離対策、資源配分に資する。

限界

• 観察研究であり因果推論に限界、サンプリングバイアスや日本以外への一般化に制約がある。
• 経験的治療変更などの臨床運用の検証は前向きに行われていない。

今後の方向性

高リスクMRSA系統の認識が死亡率や伝播を低減するか、ゲノム情報に基づく前向き抗菌薬適正使用介入で検証する。